Marmara Üniversitesi Sağlık Yönetimi Bölümü; 03 Kasım 1994 tarihli resmi gazete de yayımlanan Bakanlar Kurulu Kararı ile kurulmuş olan "Sağlık Eğitim Fakültesi"nin bir bölümü olarak eğitim vermeye başlamıştır. SYB alanında öncü bir bölüm olarak eğitim ve öğretim hayatına 1996 yılından 2003 yılına kadar SEF altında devam etmiştir. Yükseköğretim Kurulu'nun Sağlık Eğitim Fakültesi'ni kapatma düşüncesi üzerine, 2002 yılında Fakülte Yönetimi, Türkiye'de ilk kez  "Sağlık Bilimleri Fakültesine" dönüşme talebini (24 Ekim 2002) dile getirmiş ve 10.06.2003 tarihli Marmara Üniversitesi Senatosu "Fizyoterapi ve Rehabilitasyon" ve "Beslenme ve Diyetetik" bölümlerinin açılmasını uygun görerek, Yükseköğretim Kurulu'na arz etmiştir. Yükseköğretim Kurulu'nun 21.04.2006 tarih ve 1185-008736 sayılı "Sağlık Bilimleri Fakülte"leri kurulmasına ilişkin tavsiye kararı ve Yükseköğretim Kurulu Başkanlığının 29.06.2007 tarih ve 2419-015995 sayılı onay kararı ile 13 Haziran 2007 tarihli ve 26551 sayılı Resmi Gazetede yayımlanması ile "Sağlık Bilimleri Fakültesi" adı altında yeniden yapılanmıştır. SYB 2007 yılından itibaren SBF altında faaliyet göstermektedir.